目前在临床上沉香曲这种中药尚无明显的副作用。沉香曲性温，出现实火、阴虚内热、肝阳上亢等症状及妊娠妇女忌服。
沉香曲以沉香等多种药末和神曲糊制成，味苦香，性温，成分包括沉香、木香、柴胡、厚朴以及豆蔻等，具有疏表化滞和舒肝和胃的功效，不仅能够治疗感冒风寒引起的食积气滞、胸腹胀痛以及呕吐吞酸等症状，还可帮助患者理脾和胃。
患者在服用沉香曲期间不可食用过于油腻和辛辣等刺激性食物，以免影响药物的治疗效果，而且本品不宜久服，患者需根据自身病情在医生的指导下或按照说明书用法用量服用，若患者在服药三天后症状仍未改善或加重，应立即停药并观察自身情况，必要时医院就诊。另外，与其他药物同时使用可能会发生药物相互作用，若患者正在使用其他药品，使用本品前需咨询相关医师或药师，建议不要私自用药，以免出现严重后果，加重病情。
